本作承接《奥特银河格斗2：巨大阴谋》，讲述奥特英雄们与阿布索留特人之间惊动银河的命运之战。　　同时新的奥特战士——雷古洛思奥特曼和阿布索留特人的战士——迪亚波罗亦将登场。

作为民间警备组织E.G.I.S.的一员工作的工藤优信，有着变身为泰迦，泰塔斯，风马这个3人的奥特曼的能力。经过与无数敌人的战斗，优信和泰迦之间的羁绊更加深厚。但是，他们现在却被什么人瞄准了。知道这件事后，新生代的奥特曼们为了拯救…

魔爪伸向了M78星云·光之国！受到了不知是谁的攻击，被铭刻在脉搏上的“新生代奥特曼”的记忆丢失了。接受了“对奥特曼羁绊的挑战”的光之国，又一讯息到来了。那是新的光之道具“次元格斗仪”，上面托付了未来人的信息。为了找回丢失的…