野矢一树是转入公立海老栖川高校的新生，对天文感兴趣的他本想申请加入天文部，但却错入部室，成为了原本仅由女生组成的天闷部的一员。在这里，一树遇到了个性鲜明的女生部员们，有常常搞出问题来的户田山响子、天闷部的唯一常识人广松理…

地球即将被毁灭，妮姆芙、阿斯特雷亚纷纷死去……　　为了拯救世界，仅剩的伊卡洛斯带着樱井智树飞往天空之城--西纳普斯。　　美丽的空中，伊卡洛斯回想起过去的日子……　　和主人在一起的时光，每一天、每一分、每一秒，都很幸福……　…

有着人类少女的样貌，却不同于人类的存在――精灵。 她们拥有强大的能力，从邻界现身时，因为会伴随名为『空间震』的灾难，她们甚至被称为人类的天敌。 面对精灵的威胁，人类能采取的手段，是以武力歼灭，或是―― 『与精灵约会，使其娇…